Le papayer se propage normalement par les graines. Les graines extraites des papayes mures sont d'abord lavées pour ôter l'enveloppe gélatineuse, séchées et saupoudrées de fongicide. Les graines doivent être semées le plus rapidement possible parce qu'elles perdent vite leur viabilité lorsqu'elles sont stockées. Après un trempage d'une nuit, les graines de papayer peuvent être semées dans des bacs à sable ou directement dans des sacs en plastique. Le terreau utilisé est composé à 50% de sable pour faciliter le drainage, à 25% d'engrais organique et à 25% de terre sur le dessus. Normalement, une quantité de 30 à 50 g de graine par hectare est requise. Les graines sont semées à une profondeur de 1 cm et à 2,5 cm d'écart, dans un lieu ombragé à 75%.

Un trempage du sol avec du benomyl ou de fongicide captane peut être nécessaire pour prévenir la fonte ( Pythium spp .). Un mélange jardinier stérile peut également être utilisé parce que les jeunes plants de papayers ont un taux de mortalité élevé à cause de la fonte. Pour préparer le mélange stérile, il faut placer moitié-moitié de terre et de vermiculite dans un four à 93° c pendant une heure. Sous des conditions idéales, la graine germe habituellement en environ deux semaines, mais cela peut prendre trois à cinq semaines. L'acide gibbérellique peut être utilisé pour accélérer la germination. Après 6 à 8 semaines, les plants sont prêts pour la transplantation. Parce que les plants de papayers ne supportent pas bien la transplantation, ils doivent être préparés de façon à n'être transplantés qu'une fois, quand ils sont en terre. Pendant la transplantation, il faut s'assurer de ne pas abîmer la boule de racine. Les plants transplantés doivent être arrosés régulièrement jusqu'à ce qu'ils soient solides.

Bien que ce ne soit pas une pratique fréquente, les papayers peuvent aussi être cultivés par bouture. Cette dernière doit être fortifiée pendant quelques jours et ensuite soutenue, l'extrémité touchant la terre humide et fertile jusqu'à la formation de racine. Quand les boutures à bois semi durci sont plantées, ils forment des racines rapidement.